Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csrnp3P59055 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms