Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gsc2P56916 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms