Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcanP55066 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcanP55066 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NcanP55066 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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NcanP55066 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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NcanP55066 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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NcanP55066 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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NcanP55066 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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NcanP55066 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NcanP55066 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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