Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms