Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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