Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hoxc13P50207 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hoxc13P50207 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hoxc13P50207 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hoxc13P50207 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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