Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ItgavP43406 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ItgavP43406 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms