Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms