Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms