Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VhlP40338 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms