Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms