Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dusp1P28563 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms