Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms