Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms