Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P04212 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P04212 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms