Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms