Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01644 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01644 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01644 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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