Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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