Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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