Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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