Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BckdkO55028 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BckdkO55028 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms