Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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H2-Q1O19441 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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H2-Q1O19441 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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H2-Q1O19441 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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H2-Q1O19441 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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H2-Q1O19441 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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H2-Q1O19441 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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H2-Q1O19441 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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H2-Q1O19441 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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