Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms