Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms