Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5458L7N219 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5458L7N219 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms