Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms