Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms