Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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