Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms