Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Myo5cE9Q1F5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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