Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx60E9PZQ1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms