Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms