Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.3 ms