Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms