Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms