Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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