Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms