Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Letm1Q9Z2I0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Letm1Q9Z2I0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Letm1Q9Z2I0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Letm1Q9Z2I0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Letm1Q9Z2I0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Letm1Q9Z2I0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Letm1Q9Z2I0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Letm1Q9Z2I0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Letm1Q9Z2I0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm1Q9Z2I0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm1Q9Z2I0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm1Q9Z2I0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm1Q9Z2I0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm1Q9Z2I0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm1Q9Z2I0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm1Q9Z2I0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms