Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms