Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms