Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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