Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rabgef1Q9JM13 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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