Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Tgm1Q9JLF6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Tgm1Q9JLF6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Tgm1Q9JLF6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Tgm1Q9JLF6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Tgm1Q9JLF6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.5 ms