Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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