Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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