Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim23Q9DAL0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms