Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms