Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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