Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms