Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp5Q9D7S9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms